Page 115 - 《广西植物》2023年第10期
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10 期 王玉凤等: 欧耧斗菜 AP2 / ERF 基因家族鉴定及盐胁迫下表达分析 1 8 6 9
图 2 欧耧斗菜 AP2 / ERF 保守基序
Fig. 2 Conserved motifs of AP2/ ERF in Aquilegia vulgaris
并对其家族成员理化特征、系统进化及盐胁迫下 在 AP2 / ERF 转录因子中ꎬAP2 结构域的高度
表达模式进行了分析ꎮ 86 个 AvAP2 / ERF 可被分 保守是其蛋白序列的重要结构特征ꎬ通常该结构域
为 15 个 AP2 基因、29 个 DREB 基因、37 个 ERF 基 包含 60~70 个氨基酸残基ꎬ按照 3 个 β ̄折叠和 1 个
因、4 个 RAV 基因及 1 个 Soloist 基因ꎮ 在当前研究 α ̄螺旋方式形成典型的三维结构( 洪林等ꎬ2020)ꎮ
的大多植物中ꎬERF 亚家族具有最多的成员ꎬ然后 在欧耧斗菜 AP2 / ERF 转录因子家族中ꎬMotif 1 和
依次是 DREB、AP2、RAVꎬSoloist 亚家族成员最少 Motif 2 是保守性最高的ꎬ是构成 AP2 结构域的重要
(Nakano et al.ꎬ 2006)ꎮ 欧耧斗菜与拟南芥、水稻 组成部分ꎬ这与前人的研究结果基本相符ꎮ 保守的
等物种的 AP2 / ERF 基因的各亚家族成员在数量 结构域与基序通常与转录因子的功能相关(Sakuma
上也具 有 相 似 的 规 律 ( Akhter et al.ꎬ 2011ꎻ 陈 悦 et al.ꎬ 2002)ꎮ 在欧耧斗菜 AP2 / ERF 转录因子家族
等ꎬ2022)ꎬ这说明植物 AP2 / ERF 基因在进化上有 中ꎬ同一亚家族基因具有相同或相似的保守基序ꎬ
共同的起源ꎮ 可能具有相似的生物学功能和调控途径ꎮ 如 AP2
本研究发现欧耧斗菜 AP2 / ERF 转录因子家 亚家族有两段保守基序 Motif 4 和 Motif 13ꎬ构成了
族成员的分子量、等电点和亲水性存在较大差异ꎬ 另一个长度为 72 个氨基酸的 AP2 结构域ꎬRAV 亚
这与前人的研究结果一致( Ran et al.ꎬ 2022)ꎬ说 家族中也有两段保守基序 Motif 9 和 Motif 15ꎬ是 B3
明了欧耧斗菜 AP2 / ERF 转录因子家族的结构较 结构域的重要组成部分ꎬ而这在其他亚家族中则不
为复杂ꎬ暗示了其功能的多样性ꎮ 欧耧斗菜 AP2 / 具备ꎬ这符合 AP2 亚家族和 RAV 亚家族的基本特
ERF 的亚细胞定位大多数在细胞核ꎬ说明其在细 征(苟艳丽等ꎬ2020)ꎮ 不同亚家族特异的保守基序
胞质中合成后进入细胞核发挥作用ꎻ也有在叶绿 在转录调控中同样发挥了重要的作用ꎮ
体中和线粒体中的ꎬ这说明其功能分工上有所不 根据与已知功能基因的同源性ꎬ结合表达趋
同ꎬ在信号传递的不同阶段发挥作用ꎮ 势推测目的基因的功能是目前研究中常用的手段