Page 126 - 《广西植物》2023年第10期
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１ ８ ８ ０ 广 西 植 物 ４３ 卷
前三条染色体代表大麻状罗布麻ꎬ后四条染色体代表罗布麻ꎮ
Ｔｈｅ ｆｉｒｓｔ ｔｈｒｅｅ ｃｈｒｏｍｏｓｏｍｅｓ ｒｅｐｒｅｓｅｎｔ Ａｐｏｃｙｎｕｍ ｃａｎｎａｂｉｎｕｍꎬ ａｎｄ ｔｈｅ ｌａｓｔ ｆｏｕｒ ｃｈｒｏｍｏｓｏｍｅｓ ｒｅｐｒｅｓｅｎｔ Ａ. ｖｅｎｅｔｕｍ.
图 １ 两种罗布麻 ＵＶＲ８ 基因的染色体定位
Ｆｉｇ. １ Ｃｈｒｏｍｏｓｏｍａｌ ｌｏｃａｔｉｏｎ ｏｆ ＵＶＲ８ ｇｅｎｅｓ ｉｎ ｔｗｏ ｓｐｅｃｉｅｓ ｏｆ Ａｐｏｃｙｎｕｍ
染色体上ꎬ其中 ＡｃＵＶＲ８ｅ 分布在 ８ 号染色体ꎬ１ 和 ９ ＡｃＵＶＲ８ 则各有 ７ 个 ｍｏｔｉｆꎮ 同种罗布麻的 ＵＶＲ８
号染色体则各分布有 ２ 个 ＡｃＵＶＲ８ 基因ꎬ 分别是 ｍｏｔｉｆ 之间存在一定差异ꎬ但两种罗布麻的 ＵＶＲ８
ＡｃＵＶＲ８ｂ 和 ＡｃＵＶＲ８ｃꎬＡｃＵＶＲ８ａ 和 ＡｃＵＶＲ８ｄꎻ罗布麻 之间具有一定相似性ꎬ如 ＡｖＵＶＲ８ａ 与 ＡｃＵＶＲ８ｂ、
ＡｖＵＶＲ８ 基因分布在 ４ 条染色体上ꎬ其中 ＡｖＵＶＲ８ｄ ＡｖＵＶＲ８ｂ 与 ＡｃＵＶＲ８ａ、 ＡｖＵＶＲ８ｅ 与 ＡｃＵＶＲ８ｄ、
和 ＡｖＵＶＲ８ｃ 分别分布在 ７ 和 １１ 号染色体ꎬ１ 和 ９ 号 ＡｖＵＶＲ８ｆ 与 ＡｃＵＶＲ８ｃ ｍｏｔｉｆ 的数目、位置和氨基酸
染色 体 则 各 分 布 有 ２ 个 ＡｖＵＶＲ８ 基 因ꎬ 分 别 是 组成等两两相似ꎮ
ＡｖＵＶＲ８ｆ 和 ＡｖＵＶＲ８ａ、ＡｖＵＶＲ８ｂ 和 ＡｖＵＶＲ８ｅꎮ ２.４ 两种罗布麻 ＵＶＲ８ 蛋白质理化性质分析
２.３ 两种罗布麻 ＵＶＲ８ 基因结构和蛋白保守结构 采用 ＥｘＰＡＳｙ 工具对 ＵＶＲ８ 蛋白理化性质进
域分析 行预 测ꎬ 结 果 ( 表 ２) 表 明ꎬ ＡｖＵＶＲ８ 蛋 白 长 度 为
通过两种罗布麻基因组注释 ｇｆｆ３ 文件ꎬ采用 ４２０ ~ ５３４ ａａꎬ 相 对 分 子 质 量 在 ４５ ８４６. １０ ~
ＧＳＤＳ ２.０ 软件对 ＵＶＲ８ 基因结构进行分析ꎮ 结果 ５６ ８２７.２０ Ｄａ 之间ꎬ理论等电点在 ５.５５ ~ ８.４１ 之
表明ꎬＵＶＲ８ 基因皆含上、下游非编码区、内含子和 间ꎮ 其中ꎬＡｖＵＶＲ８ｃ 的氨基酸数、相对分子质量和
外显子ꎬ但基因长度不同ꎬ外显子数也存在差异 理论等电点最高ꎬ分别为 ５３４ ａａ、５６ ８２７.２０ Ｄａ 和
(图 ２)ꎮ ＡｖＵＶＲ８ 基因长度为 ５ １１５ ~ １２ ６７２ ｂｐꎬ外 ８.４１ꎻＡｖＵＶＲ８ｄ 的氨基酸数和相对分子质量最小ꎬ
显子数有 ６ ~ １６ 个ꎬ其中 ＡｖＵＶＲ８ｃ 外显子数最高 分别为 ４２０ ａａ 和 ４５ ８４６.１０ Ｄａꎮ 当蛋白不稳定指
(１６ 个)ꎬＡｖＵＶＲ８ａ 外显子数最低(６ 个)ꎮ ＡｃＵＶＲ８ 数>４０ 时ꎬ判定该蛋白为不稳定蛋白ꎻ当蛋白不稳
基因长度为 ５ ８７６ ~ １１ ５８５ ｂｐꎬＡｃＵＶＲ８ 外显子数有 定指数<４０ 时ꎬ判定该蛋白为稳定蛋白( 夏巧玉ꎬ
６ ~ １５ 个ꎬ其中 ＡｃＵＶＲ８ｄ 外显子数最高( １５ 个)ꎬ ２００７)ꎮ ＡｖＵＶＲ８ 蛋白的不稳定指数皆小于 ４０ꎬ为
ＡｃＵＶＲ８ｂ 外显子数最低(６ 个)ꎮ 此外ꎬ利用 ＭＥＭＥ 稳定 蛋 白ꎬ 其 中 ＡｖＵＶＲ８ｂ 的 不 稳 定 指 数 最 高
软件分析 ＵＶＲ８ 蛋白保守结构域( ｍｏｔｉｆ)ꎬｍｏｔｉｆ 设 (３８.８９)ꎬＡｖＵＶＲ８ｄ 的不稳定指数最低( ３１.１２)ꎮ
为 ７ꎬ其他参数为默认值ꎮ 由图 ３ 可知ꎬＡｖＵＶＲ８ ＡｖＵＶＲ８ 蛋白脂肪族氨基酸指数在 ６３.５０ ~ ８５.１７
的 ｍｏｔｉｆ 数为 ４ ~ ７ 个ꎬ其中 ＡｖＵＶＲ８ｂ、ＡｖＵＶＲ８ｅ 和 之间ꎬ亲水性平均值在－ ０.６２９ ~ － ０.１３４ 之间且小
ＡｖＵＶＲ８ｆ 的 ｍｏｔｉｆ 数 最 多 ( ７ 个)ꎬ ＡｖＵＶＲ８ｃ ｍｏｔｉｆ 于 ０ꎬ为 亲 水 性 蛋 白ꎮ 仅 ＡｖＵＶＲ８ａ、 ＡｖＵＶＲ８ｂ 和
数最少(４ 个)ꎮ ＡｃＵＶＲ８ 的 ｍｏｔｉｆ 数为 ６ ~ ７ 个ꎬ其 ＡｖＵＶＲ８ｆ 理论等电点<７ꎬ为酸性蛋白ꎬ其余 ３ 个为
中 ＡｃＵＶＲ８ｂ 的 ｍｏｔｉｆ 数 最 少 ( ６ 个)ꎬ 其 他 ４ 个 碱性蛋白ꎮ
