Page 128 - 《广西植物》2023年第10期
P. 128
１ ８ ８ ２ 广 西 植 物 ４３ 卷
表 ２ 两种罗布麻 ＵＶＲ８ 蛋白理化性质
Ｔａｂｌｅ ２ Ｐｈｙｓｉｃａｌ ａｎｄ ｃｈｅｍｉｃａｌ ｐｒｏｐｅｒｔｉｅｓ ｏｆ ＵＶＲ８ ｐｒｏｔｅｉｎｓ ｉｎ ｔｗｏ ｓｐｅｃｉｅｓ ｏｆ Ａｐｏｃｙｎｕｍ
相对分子质量
氨基酸数 Ｒｅｌａｔｉｖｅ 理论等电点 不稳定指数 脂肪族 亲水性平均值
蛋白
Ｎｕｍｂｅｒ ｏｆ ａｍｉｎｏ ａｃｉｄｓ ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｔｈｅｏｒｅｔｉｃａｌ Ｉｎｓｔａｂｉｌｉｔｙ 氨基酸指数 Ｇｒａｎｄ ａｖｅｒａｇｅ ｏｆ
Ｐｒｏｔｅｉｎ
(ａａ) ｗｅｉｇｈｔ ｐＩ ｉｎｄｅｘ Ａｌｉｐｈａｔｉｃ ｉｎｄｅｘ ｈｙｄｒｏｐｔｈｉｌｉｃｉｔｙ
(Ｄａ)
ＡｖＵＶＲ８ａ ４８８ ５３ １４０.０２ ６.８４ ３１.３４ ８３.０５ －０.１３４
ＡｖＵＶＲ８ｂ ４７１ ５１ ２２０.４３ ５.５５ ３８.８９ ７８.００ －０.２３９
ＡｖＵＶＲ８ｃ ５３４ ５６ ８２７.２０ ８.４１ ３３.６１ ６３.５０ －０.６２９
ＡｖＵＶＲ８ｄ ４２０ ４５ ８４６.１０ ８.２９ ３１.１２ ８５.１７ －０.２９１
ＡｖＵＶＲ８ｅ ４３７ ４７ ００７.００ ７.２２ ３５.５３ ７７.４１ －０.２３７
ＡｖＵＶＲ８ｆ ４７３ ５１ ０５０.２３ ５.９３ ３１.７９ ７６.９１ －０.２６２
ＡｃＵＶＲ８ａ ４８５ ５２ ８１９.２３ ５.７０ ３７.７０ ７８.９５ －０.２４１
ＡｃＵＶＲ８ｂ ４８８ ５３ ２３３.１９ ８.０８ ３１.５６ ８１.０７ －０.１６２
ＡｃＵＶＲ８ｃ ４７３ ５１ ０３２.２８ ６.２８ ３２.９５ ７７.７４ －０.２７５
ＡｃＵＶＲ８ｄ ４３７ ４６ ９９２.０８ ７.９６ ３４.４０ ７７.８７ －０.２３８
ＡｃＵＶＲ８ｅ ３８８ ４１ ７７８.９６ ５.４２ ３６.３８ ８２.４２ －０.０４７
ＡｃＵＶＲ８ 蛋白长度为 ３８８ ~ ４８８ ａａꎬ相对分子 表 ３ 两种罗布麻 ＵＶＲ８ 蛋白二级结构组成
质量在 ４１ ７７８.９６ ~ ５３ ２３３.１９ Ｄａ 之间ꎬ理论等电点 Ｔａｂｌｅ ３ Ｓｅｃｏｎｄａｒｙ ｓｔｒｕｃｔｕｒｅ ｃｏｍｐｏｓｉｔｉｏｎ ｏｆ ＵＶＲ８ ｐｒｏｔｅｉｎｓ
ｉｎ ｔｗｏ ｓｐｅｃｉｅｓ ｏｆ Ａｐｏｃｙｎｕｍ
在 ５.４２ ~ ８.０８ 之间ꎮ 其中 ＡｃＵＶＲ８ｂ 的氨基酸数、
α￣螺旋 延伸链 β￣转角 无规则卷曲
相对分子质量和理论等电点最高ꎬ分别为 ４８８ ａａ、
蛋白质 Ａｌｐｈａ Ｅｘｔｅｎｄｅｄ Ｂｅｔａ Ｒａｎｄｏｍ
５３ ２３３.１９ Ｄａ 和 ８.０８ꎻＡｃＵＶＲ８ｅ 的氨基酸数、相对 Ｐｒｏｔｅｉｎ ｈｅｌｉｘ ｓｔｒａｎｄ ｔｕｒｎ ｃｏｉｌ
(％) (％) (％) (％)
分子 质 量 和 理 论 等 电 点 最 小ꎬ 分 别 为 ３８８ ａａ、
ＡｖＵＶＲ８ａ ２３.５７ ２２.５４ ８.４０ ４５.４９
４１ ７７８.９６ Ｄａ 和 ５.４２ꎮ ＡｃＵＶＲ８ 蛋白的不稳定指
ＡｖＵＶＲ８ｂ １３.３８ ２５.９０ ８.０７ ５２.６５
数皆小于 ４０ꎬ为稳定蛋白ꎬ其中 ＡｃＵＶＲ８ａ 的不稳
ＡｖＵＶＲ８ｃ １１.９９ ２２.２８ ７.６８ ５８.０５
定指数最高(３７.７０)ꎬＡｖＵＶＲ８ｂ 的不稳定指数最低
ＡｖＵＶＲ８ｄ １０.２４ ２５.９５ ８.１０ ５５.７１
(３１.５６)ꎮ ＡｃＵＶＲ８ 蛋 白 脂 肪 族 氨 基 酸 指 数 在
ＡｖＵＶＲ８ｅ １３.７３ ２７.４６ ８.２４ ５０.５７
７７.７４ ~ ８２. ４２ 之 间ꎬ 亲 水 性 平 均 值 在 － ０. ２７５ ~
－０.０４７ 之 间 且 小 于 ０ꎬ 为 亲 水 性 蛋 白ꎮ 仅 ＡｖＵＶＲ８ｆ １８.３９ ２２.６２ ７.４０ ５１.５９
ＡｃＵＶＲ８ｂ 和 ＡｃＵＶＲ８ｄ 理论等电点 > ７ꎬ为碱性蛋 ＡｃＵＶＲ８ａ １２.１６ ２８.０４ ９.９０ ４９.９０
ＡｃＵＶＲ８ｂ １８.４４ ２４.３９ ９.０２ ４８.１６
白ꎬ其余 ３ 个为酸性蛋白ꎮ
２.５ 两 种 罗 布 麻 ＵＶＲ８ 蛋 白 结 构 分 析 和 亚 细 胞 ＡｃＵＶＲ８ｃ １５.０１ ２３.０４ ７.８２ ５４.１２
定位 ＡｃＵＶＲ８ｄ １６.０２ ２６.３２ ９.３８ ４８.２８
ＡｃＵＶＲ８ｅ ６.３６ ２７.２３ ８.９１ ５７.５１
利用 ＳＯＰＭＡ 软件分析 ＵＶＲ８ 蛋白二级结构ꎬ
结果表明ꎬＵＶＲ８ 蛋白二级结构由 α￣螺旋 ( ａｌｐｈａ
ｈｅｌｉｘ)、 β￣转 角 ( ｂｅｔａ ｔｕｒｎ )、 延 伸 链 ( ｅｘｔｅｎｄｅｄ 线软件ꎬ选择 Ｅｕｋ￣ＰＬｏｃ ２.０ 对 ＵＶＲ８ 蛋白进行核
ｓｔｒａｎｄ)和无规则卷曲(ｒａｎｄｏｍ ｃｏｉｌ)４ 部分组成( 表 定位预测ꎬ结果显示 ＵＶＲ８ 蛋白皆定位在细胞核ꎮ
３ꎬ图 ４)ꎮ 其中无规 则 卷 曲 占 比 最 高 ( ４５. ４９％ ~ 以 ＡｔＵＶＲ８ 蛋白为模板ꎬ采用软件 Ｐｈｙｒｅ２ 预
５８.０５％)ꎬ其次为延伸链(２２.２８％ ~ ２８.０４％)ꎬβ￣转 测 ＵＶＲ８ 三 级 结 构ꎮ 发 现 仅 ＡｖＵＶＲ８ｂ 和
角占比最低(７.４０％ ~ ９.９０％)ꎬ可见延伸链、无规 ＡｃＵＶＲ８ａ 三级结构同 ＡｔＵＶＲ８ 相似ꎬ单体由 ７ 个
则卷曲和 α￣螺旋结构为 ＵＶＲ８ 蛋白二级结构的主 完整的 ＲＣＣ１ 保守基序形成七叶 β￣折叠结构ꎬ而
要组成部分ꎮ 另外ꎬ 本研究通过 Ｃｅｌｌ ＰＬｏｃ ２.０ 在 其他 ＵＶＲ８ 蛋白结构因 ＲＣＣ１ 保守基序不完整或
