Page 173 - 《广西植物》2023年第10期
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１０ 期 赵渊祥等: 猴樟叶绿体基因组特征分析 １ ９ ２ ７
表 ２ 猴樟叶绿体基因组相对同义密码子使用(ＲＳＣＵ)情况分析
Ｔａｂｌｅ ２ Ｒｅｌａｔｉｖｅ ｓｙｎｏｎｙｍｏｕｓ ｃｏｄｏｎ ｕｓａｇｅ (ＲＳＣＵ) ａｎａｌｙｓｉｓ ｏｆ Ｃｉｎｎａｍｏｍｕｍ ｂｏｄｉｎｉｅｒｉ ｃｈｌｏｒｏｐｌａｓｔ ｇｅｎｏｍｅ
氨基酸 密码子 数量(ＲＳＣＵ) 氨基酸 密码子 数量(ＲＳＣＵ)
Ａｍｉｎｏ ａｃｉｄ Ｃｏｄｏｎ Ｎｕｍｂｅｒ (ＲＳＣＵ) Ａｍｉｎｏ ａｃｉｄ Ｃｏｄｏｎ Ｎｕｍｂｅｒ (ＲＳＣＵ)
苯丙氨酸 ＵＵＵ ７６０(１.１１)∗ 丝氨酸 ＵＣＵ ４９０(１.４５)∗
Ｐｈｅｎｙｌａｌａｎｉｎｅ ＵＵＣ ６０５(０.８９) Ｓｅｒｉｎｅ ＵＣＣ ３７９(１.１２)∗
亮氨酸 ＵＵＡ ６６２(１.４９)∗ ＵＣＡ ４１３(１.２３)∗
Ｌｅｕｃｉｎｅ ＵＵＧ ５７８(１.３０)∗ ＵＣＧ ２０９(０.６２)
ＣＵＵ ５１３(１.１５)∗ 脯氨酸 ＣＣＵ ３８４(１.２９)∗
ＣＵＣ ２６５(０.６０) Ｐｒｏｌｉｎｅ ＣＣＣ ２８５(０.９６)
ＣＵＡ ４１９(０.９４) ＣＣＡ ３２３(１.０９)∗
ＣＵＧ ２３３(０.５２) ＣＣＧ １９５(０.６６)
异亮氨酸 ＡＵＵ ９１３(１.３３)∗ 苏氨酸 ＡＣＵ ４３７(１.３９)∗
Ｉｓｏｌｅｕｃｉｎｅ ＡＵＣ ５０３(０.７３) Ｔｈｒｅｏｎｉｎｅ ＡＣＣ ２９５(０.９４)
ＡＵＡ ６４１(０.９３) ＡＣＡ ３４９(１.１１)∗
甲硫氨酸 ＡＵＧ ５８１(１.００) ＡＣＧ １７８(０.５７)
Ｍｅｔｈｉｏｎｉｎｅ
缬氨酸 ＧＵＵ ４８９(１.３２)∗ 丙氨酸 ＧＣＵ ５６４(１.６４)∗
Ｖａｌｉｎｅ ＧＵＣ ２１４(０.５８) Ａｌａｎｉｎｅ ＧＣＣ ２５５(０.７４)
ＧＵＡ ５０７(１.３７)∗ ＧＣＡ ３９４(１.１５)∗
ＧＵＧ ２７２(０.７３) ＧＣＧ １６１(０.４７)
酪氨酸 ＵＡＵ ６５３(１.４２)∗ 色氨酸 ＵＧＵ ２７４(１.２５)∗
Ｔｙｒｏｓｉｎｅ ＵＡＣ ２６６(０.５８) Ｔｒｙｐｔｏｐｈａｎ ＵＧＣ １６４(０.７５)
组氨酸 ＣＡＵ ４７９(１.４０)∗ 精氨酸 ＣＧＵ ３３４(１.１４)∗
Ｈｉｓｔｉｄｉｎｅ ＣＡＣ ２０５(０.６０) Ａｒｇｉｎｉｎｅ ＣＧＣ １３０(０.４４)
谷氨酰胺 ＣＡＡ ６４８(１.３５)∗ ＣＧＡ ３７６(１.２９)∗
Ｇｌｕｔａｍｉｎｅ ＣＡＧ ３０９(０.６５) ＣＧＧ １９１(０.６５)
天冬酰胺 ＡＡＵ ７６９(１.４１)∗ 丝氨酸 ＡＧＵ ３５７(１.０６)∗
Ａｓｐａｒａｇｉｎｅ ＡＡＣ ３２５(０.５９) Ｓｅｒｉｎｅ ＡＧＣ １７４(０.５２)
赖氨酸 ＡＡＡ ９１１(１.３８)∗ 精氨酸 ＡＧＡ ４６１(１.５８)∗
Ｌｙｓｉｎｅ ＡＡＧ ４１２(０.６２) Ａｒｇｉｎｉｎｅ ＡＧＧ ５４２(１.１７)∗
天冬氨酸 ＧＡＵ ６６６(１.４７)∗ 甘氨酸 ＧＧＵ ３７５(０.９０)
Ａｓｐａｒｔｉｃ ａｃｉｄ ＧＡＣ ２３８(０.５３) Ｇｌｙｃｉｎｅ ＧＧＣ ２６２(０.５７)
谷氨酸 ＧＡＡ ８８８(１.３８)∗ ＧＧＡ ６７７(１.４２)∗
Ｇｌｕｔａｍｉｃ ａｃｉｄ ＧＡＧ ３９８(０.６２) ＧＧＧ ３７１(０.６０)
终止密码子 ＵＡＡ １９６(１.０６)∗ 终止密码子 ＵＧＡ １６３(０.８８)
Ｔｅｒｍｉｎａｔｉｏｎ Ｔｅｒｍｉｎａｔｉｏｎ
ＵＡＧ １９５(１.０６)∗ ＵＧＧ ４４３(１.００)
ｃｏｄｏｎ ｃｏｄｏｎ
注: ∗表示 ＲＳＣＵ>１ꎮ
Ｎｏｔｅ: ∗ ｉｎｄｉｃａｔｅｓ ＲＳＣＵ>１.
(Ｈｕａｎｇ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０１４)ꎮ 猴樟叶绿体基因全长 １５２ 物叶绿体基因组相近( Ｚｈａｎｇ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０２１)ꎬ并且
７２７ ｂｐꎬＩＲ 区全长 ２０ １３２ ｂｐꎬ其全长与其他樟科植 ＩＲ 区未发生明显的扩张与收缩ꎮ 猴樟叶绿体基因
