Page 171 - 《广西植物》2023年第10期

１０ 期 赵渊祥等: 猴樟叶绿体基因组特征分析 １ ９ ２ ５

表 １ 猴樟叶绿体基因组注释基因信息
Ｔａｂｌｅ １ Ａｎｎｏｔａｔｅｄ ｇｅｎｅ ｉｎｆｏｒｍａｔｉｏｎ ｏｆ Ｃｉｎｎａｍｏｍｕｍ ｂｏｄｉｎｉｅｒｉ ｃｈｌｏｒｏｐｌａｓｔ ｇｅｎｏｍｅ

基因功能分类 基因种类 基因 ＩＤ
Ｇｅｎｅ ｆｕｎｃｔｉｏｎａｌ ｃｌａｓｓｉｆｉｃａｔｉｏｎ Ｇｅｎｅ ｇｒｏｕｐ Ｇｅｎｅ ＩＤ
光合作用相关基因 光系统Ⅰ ｐｓａＢꎬ ｐｓａＡꎬ ｐｓａＩꎬ ｐｓａＪꎬ ｐｓａＣ
Ｐｈｏｔｏｓｙｎｔｈｅｓｉｓ ｒｅｌａｔｅｄ ｇｅｎｅ Ｐｈｏｔｏｓｙｓｔｅｍ Ⅰ
光系统Ⅱ ｐｓｂＡꎬ ｐｓｂＫꎬ ｐｓｂＩꎬ ｐｓｂＭꎬ ｐｓｂＤꎬ ｐｓｂＣꎬ ｐｓｂＺꎬ ｐｓｂＪꎬ ｐｓｂＬꎬ ｐｓｂＦꎬ
Ｐｈｏｔｏｓｙｓｔｅｍ Ⅱ ｐｓｂＥꎬ ｐｓｂＢꎬ ｐｓｂＴꎬ ｐｓｂＮꎬ ｐｓｂＨ
细胞色素 ｂ / ｆ 复合体 ｐｅｔＮꎬ ｐｅｔＡꎬ ｐｅｔＬꎬ ｐｅｔＧꎬ ｐｅｔＢ ꎬ ｐｅｔＤ
ａ
Ｃｙｔｏｃｈｒｏｍｅ ｂ / ｆ ｃｏｍｐｌｅｘ
ＡＴＰ 合酶 ａｔｐＡꎬ ａｔｐＦ ꎬ ａｔｐＨꎬ ａｔｐＩꎬ ａｔｐＥꎬ ａｔｐＢ
ａ
ＡＴＰ ｓｙｎｔｈａｓｅ
ＮＡＤＨ 脱氢酶 ｎｄｈＪꎬ ｎｄｈＫꎬ ｎｄｈＣꎬ ｎｄｈＢ ∗ ２ ａ ꎬ ｎｄｈＦꎬ ｎｄｈＤꎬ ｎｄｈＥꎬ ｎｄｈＧꎬ
ａ
ＮＡＤＨ ｄｅｈｙｄｒｏｇｅｎａｓｅ ｎｄｈＩꎬ ｎｄｈＡ ꎬ ｎｄｈＨ
二磷酸核酮糖羧化酶大亚基 ｒｂｃＬ
ＲｕｂｉｓＣＯ ｌａｒｇｅ ｓｕｂｕｎｉｔ
自我复制相关基因 ＲＮＡ 聚合酶 ｒｐｏＣ２ꎬ ｒｐｏＣ１ ꎬ ｒｐｏＢꎬ ｒｐｏＡ
ａ
Ｓｅｌｆ￣ｒｅｐｌｉｃａｔｉｎｇ ｒｅｌａｔｅｄ ｇｅｎｅ ＲＮＡ ｐｏｌｙｍｅｒａｓｅ
核糖体蛋白小亚基 ｒｐｓ１２ ∗２ ｂ ꎬ ｒｐｓ１６ ꎬ ｒｐｓ２ꎬ ｒｐｓ１４ꎬ ｒｐｓ４ꎬ ｒｐｓ１８ꎬ ｒｐｓ１１ꎬ ｒｐｓ８ꎬ ｒｐｓ３ꎬ
ａ
Ｒｉｂｏｓｏｍａｌ ｐｒｏｔｅｉｎ ｓｍａｌｌ ｓｕｂｕｎｉｔ ｒｐｓ１９ꎬ ｒｐｓ７ ∗２ ꎬ ｒｐｓ１５ꎬ ｒｐｓ７
核糖体蛋白大亚基 ｒｐｌ３３ꎬ ｒｐｌ２０ꎬ ｒｐｌ３６ꎬ ｒｐｌ１４ꎬ ｒｐｌ１６ꎬ ｒｐｌ２ ꎬ ｒｐｌ２３ꎬ ｒｐｌ３２
ａ
Ｒｉｂｏｓｏｍａｌ ｐｒｏｔｅｉｎ ｌａｒｇｅ ｓｕｂｕｎｉｔ
ａ
转运 ＲＮＡ ｔＲＮＡ－Ｈｉｓꎬ ｔＲＮＡ－Ｌｙｓ ꎬ ｔＲＮＡ－Ｇｌｎꎬ ｔＲＮＡ－Ｓｅｒ ∗ ３ ꎬ ｔＲＮＡ－Ｇｌｙ ∗２ ａ ꎬ
Ｔｒａｎｓｆｅｒ ＲＮＡｓ ｔＲＮＡ－Ａｒｇ ∗ ３ ꎬ ｔＲＮＡ － Ｃｙｓꎬ ｔＲＮＡ － Ａｓｐꎬ ｔＲＮＡ － Ｔｙｒꎬ ｔＲＮＡ － Ｇｌｕꎬ
∗２ ∗ ４ ａ ∗ ３
ｔＲＮＡ－Ｔｈｒ ꎬ ｔＲＮＡ－Ｌｅｕ ꎬ ｔＲＮＡ－Ｐｈｅꎬ ｔＲＮＡ－Ｍｅｔ ꎬ ｔＲＮＡ－
∗ ３ ａ
Ｔｒｐꎬ ｔＲＮＡ－Ｐｒｏꎬ ｔＲＮＡ－Ｖａｌ ꎬ ｔＲＮＡ－ Ａｌａ ꎬ ｔＲＮＡ－ Ａｒｇꎬ ｔＲＮＡ－
ａ
Ａｓｎ ∗２ ꎬ ｔＲＮＡ－Ｉｌｅ ꎬ ｔＲＮＡ－Ｖａｌ ａ
核糖体 ＲＮＡ ｒｒｎ１６Ｓ ∗２ ꎬ ｒｒｎ４.５Ｓ ∗２ ꎬ ｒｒｎ５Ｓ ∗２ ꎬ ｒｒｎ２３Ｓ ∗２
Ｒｉｂｏｓｏｍａｌ ＲＮＡｓ
其他基因 成熟酶基因 ｍａｔＫ
Ｏｔｈｅｒ ｇｅｎｅ Ｍａｔｕｒａｓｅ ｇｅｎｅ
翻译起始因子 ｉｎｆＡ
Ｔｒａｎｓｌａｔｉｏｎａｌ ｉｎｉｔｉａｔｉｏｎ ｆａｃｔｏｒ
乙酰￣ＣｏＡ￣羧化酶亚基 ａｃｃＤ
Ｓｕｂｕｎｉｔ ｏｆ ａｃｅｔｙｌ￣ＣｏＡ ｃａｒｂｏｘｙｌａｓｅ
包膜蛋白基因 ｃｅｍＡ
Ｅｎｖｅｌｏｐ ｍｅｍｂｒａｎｅ ｐｒｏｔｅｉｎ ｇｅｎｅ
蛋白酶基因 ｃｌｐＰ ｂ
Ｐｒｏｔｅａｓｅ ｇｅｎｅ
未知功能基因 保守开放性阅读框 ｙｃｆ３ ꎬ ｙｃｆ４ꎬ ｙｃｆ２ꎬ ｙｃｆ１ ∗２ ꎬ ｙｃｆ６８ ∗２ ａ
ｂ
Ｕｎｋｎｏｗｎ ｆｕｎｃｔｉｏｎａｌ ｇｅｎｅ Ｃｏｎｓｅｒｖｅｄ ｏｐｅｎ ｒｅａｄｉｎｇ ｆｒａｍｅｓ
∗２ ∗３
注: 和 分别表示该基因拷贝 ２ 次和 ３ 次ꎻ ａ 和 ｂ 分别表示有 １ 个和 ２ 个内含子ꎮ
Ｎｏｔｅ: ∗２ ａｎｄ ∗３ ｉｎｄｉｃａｔｅ ｔｈａｔ ｔｈｅ ｇｅｎｅｓ ａｒｅ ｃｏｐｉｅｄ ｔｗｏ ａｎｄ ｔｈｒｅｅ ｔｉｍｅｓ ｒｅｓｐｅｃｔｉｖｅｌｙꎻ ａ ａｎｄ ｂ ｉｎｄｉｃａｔｅ ｔｈａｔ ｔｈｅｒｅ ａｒｅ ｏｎｅ ａｎｄ ｔｗｏ ｉｎｔｒｏｎｓꎬ
ｒｅｓｐｅｃｔｉｖｅｌｙ.

２.２ 叶绿体基因组 ＳＳＲ 位点分析 个三碱基重复序列(３.３％)、８ 个四碱基重复序列
猴樟叶绿体基因组中共检测到 ９２ 个 ＳＳＲ 位 (８.７％)、２ 个五碱基重复序列(２.２％) 以及 １ 个六
点(图 ２)ꎮ 由图 ２ 可知ꎬＳＳＲ 主要分布在 ＬＳＣ 区 碱基重复序列(１.１％)ꎮ 单核苷酸 ＳＳＲ 为多聚腺

(７０ 个ꎬ７６.１％)ꎬ其次是 ＳＳＣ 区(１８ 个 ＳＳＲ) 和 ＩＲ 嘌呤(Ａ)和多胸腺嘧啶( Ｔ) 重复ꎮ ＳＳＲ 基因序列
区(４ 个 ＳＳＲ)ꎮ ＳＳＲ 位点中包括 ６８ 个单碱基重复 碱基组成中ꎬＡ 或 Ｔ 组成的 ＳＳＲ 占 ８５.８％ꎬ表明猴
序列(７３.９％)、１０ 个二碱基重复序列(１０.９％)、３ 樟叶绿体的 ＳＳＲ 中碱基 Ａ 和 Ｔ 有明显的优势ꎮ