Page 84 - 《广西植物》2023年第8期
P. 84
１ ４ ２ ６ 广 西 植 物 ４３ 卷
ＣＡＴＣＨＥＮ Ｊꎬ ＢＡＳＳＨＡＭ Ｓꎬ ＷＩＬＳＯＮ Ｔꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０１３. Ｔｈｅ [Ｊ]. ＰＬｏＳ Ｇｅｎｅｔꎬ ５(１０): ｅ１０００６９５.
ｐｏｐｕｌａｔｉｏｎ ｓｔｒｕｃｔｕｒｅ ａｎｄ ｒｅｃｅｎｔ ｃｏｌｏｎｉｚａｔｉｏｎ ｈｉｓｔｏｒｙ ｏｆ Ｏｒｅｇｏｎ ＨＡＤＤＡＤ ＮＭꎬ ＢＲＵＤＶＩＧ ＬＡꎬ ＣＬＯＢＥＲＴ Ｊꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０１５.
ｔｈｒｅｅ ｓｐｉｎｅ ｓｔｉｃｋｌｅｂａｃｋ ｄｅｔｅｒｍｉｎｅｄ ｕｓｉｎｇ ｒｅｓｔｒｉｃｔｉｏｎ￣ｓｉｔｅ Ｈａｂｉｔａｔ ｆｒａｇｍｅｎｔａｔｉｏｎ ａｎｄ ｉｔｓ ｌａｓｔｉｎｇ ｉｍｐａｃｔ ｏｎ Ｅａｒｔｈ’ ｓ
ａｓｓｏｃｉａｔｅｄ ＤＮＡ￣ｓｅｑｕｅｎｃｉｎｇ [ Ｊ ]. Ｍｏｌ Ｅｃｏｌꎬ ２２ ( １１ ): ｅｃｏｓｙｓｔｅｍｓ [Ｊ]. Ｓｃｉ Ａｄｖꎬ １(２): ｅ１５０００５２.
２８６４－２８８３. ＨＡＭＲＩＣＫ ＪＬꎬ ＧＯＤＴ ＭＪＷꎬ １９９６. Ｅｆｆｅｃｔｓ ｏｆ ｌｉｆｅ ｈｉｓｔｏｒｙ ｔｒａｉｔｓ
ＣＡＴＣＨＥＮ Ｊꎬ ＨＯＨＥＮＬＯＨＥ ＰＡꎬ ＢＡＳＳＨＡＭ Ｓꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ ｏｎ ｇｅｎｅｔｉｃ ｄｉｖｅｒｓｉｔｙ ｉｎ ｐｌａｎｔｓ [ Ｊ]. Ｐｈｉｌｏｓｏｐｈｉｃａｌ Ｔｒａｎｓａｃ
２０１３. Ｓｔａｃｋｓ: ａｎ ａｎａｌｙｓｉｓ ｔｏｏｌ ｓｅｔ ｆｏｒ ｐｏｐｕｌａｔｉｏｎ ｇｅｎｏｍｉｃｓ Ｒｏｙａｌ Ｓｏｃ Ｌｏｎｄｏｎ. Ｓｅｒｉｅｓ Ｂ: Ｂｉｏｌ Ｓｃｉꎬ ３５１ ( １３４５ ):
[Ｊ]. Ｍｏｌ Ｅｃｏｌꎬ ２２(１１): ３１２４－３１４０. １２９１－１２９８.
ＣＨＥＮ ＸＹꎬ ２０００. Ｅｆｆｅｃｔｓ ｏｆ ｈａｂｉｔａｔ ｆｒａｇｍｅｎｔａｔｉｏｎ ｏｎ ｇｅｎｅｔｉｃ ＨＡＲＥ ＭＰꎬ ＮＵＮＮＥＹ Ｌꎬ ＳＣＨＷＡＲＴＺ ＭＫꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０１１.
ｓｔｒｕｃｔｕｒｅ ｏｆ ｐｌａｎｔ ｐｏｐｕｌａｔｉｏｎｓ ａｎｄ ｉｍｐｌｉｃａｔｉｏｎｓ ｆｏｒ ｔｈｅ Ｕｎｄｅｒｓｔａｎｄｉｎｇ ａｎｄ ｅｓｔｉｍａｔｉｎｇ ｅｆｆｅｃｔｉｖｅ ｐｏｐｕｌａｔｉｏｎ ｓｉｚｅ ｆｏｒ
ｂｉｏｄｉｖｅｒｓｉｔｙ ｃｏｎｓｅｒｖａｔｉｏｎ [Ｊ]. Ａｃｔａ Ｅｃｏｌ Ｓｉｎꎬ ２０(５): ８８４－ ｐｒａｃｔｉｃａｌ ａｐｐｌｉｃａｔｉｏｎ ｉｎ ｍａｒｉｎｅ ｓｐｅｃｉｅｓ ｍａｎａｇｅｍｅｎｔ [ Ｊ].
８９２. [陈小勇ꎬ ２０００. 生境片断化对植物种群遗传结构的 Ｃｏｎｓｅｒｖ Ｂｉｏｌꎬ ２５: ４３８－４４９.
影响及植物遗传多样性保护 [Ｊ]. 生态学报ꎬ ２０(５): ＨＥＷＩＴＴ Ｇꎬ ２０００. Ｔｈｅ ｇｅｎｅｔｉｃ ｌｅｇａｃｙ ｏｆ ｔｈｅ Ｑｕａｔｅｒｎａｒｙ ｉｃｅ ａｇｅｓ
８８４－８９２.] [Ｊ]. Ｎａｔｕｒｅꎬ ４０５: ９０７－９１３.
ＣＨＵＮＧ ＭＹꎬ ＳＯＮ ＳＷꎬ ＨＥＲＲＡＮＤＯ￣ＭＯＲＡＩＲＡ Ｓꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ ＨＯＬＳＩＮＧＥＲ ＫＥꎬ ＷＥＩＲ ＢＳꎬ ２００９. Ｇｅｎｅｔｉｃｓ ｉｎ ｇｅｏｇｒａｐｈｉｃａｌｌｙ
２０２０. Ｉｎｃｏｒｐｏｒａｔｉｎｇ ｄｉｆｆｅｒｅｎｃｅｓ ｂｅｔｗｅｅｎ ｇｅｎｅｔｉｃ ｄｉｖｅｒｓｉｔｙ ｏｆ ｓｔｒｕｃｔｕｒｅｄ ｐｏｐｕｌａｔｉｏｎｓ: Ｄｅｆｉｎｉｎｇꎬ ｅｓｔｉｍａｔｉｎｇ ａｎｄ ｉｎｔｅｒｐｒｅｔｉｎｇ
ｔｒｅｅｓ ａｎｄ ｈｅｒｂａｃｅｏｕｓ ｐｌａｎｔｓ ｉｎ ｃｏｎｓｅｒｖａｔｉｏｎ ｓｔｒａｔｅｇｉｅｓ [Ｊ]. Ｎａｔ Ｒｅｖ Ｇｅｎｅｔꎬ １０(９): ６３９－６５０.
[Ｊ]. Ｃｏｎｓｅｒｖ Ｂｉｏｌꎬ ３４(５): １１４２－１１５１. ＨＯＮＮＡＹ Ｏꎬ ＪＡＣＱＵＥＭＹＮ Ｈꎬ ２００７. Ｓｕｓｃｅｐｔｉｂｉｌｉｔｙ ｏｆ ｃｏｍｍｏｎ
ＣＯＬＥ ＣＴꎬ ２００３. Ｇｅｎｅｔｉｃ ｖａｒｉａｔｉｏｎ ｉｎ ｒａｒｅ ａｎｄ ｃｏｍｍｏｎ ｐｌａｎｔｓ ａｎｄ ｒａｒｅ ｐｌａｎｔ ｓｐｅｃｉｅｓ ｔｏ ｔｈｅ ｇｅｎｅｔｉｃ ｃｏｎｓｅｑｕｅｎｃｅｓ ｏｆ ｈａｂｉｔａｔ
[Ｊ]. Ａｎｎ Ｒｅｖ Ｅｃｏｌ Ｅｖｏｌ Ｓｙｓｔꎬ ３４(１): ２１３－２３７. ｆｒａｇｍｅｎｔａｔｉｏｎ [Ｊ]. Ｃｏｎｓｅｒｖ Ｂｉｏｌꎬ ２１(３): ８２３－８３１.
ＤＡＮＥＣＥＫ Ｐꎬ ＡＵＴＯＮ Ａꎬ ＡＢＥＣＡＳＩＳ Ｇꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０１１. Ｔｈｅ ＪＡＮＳＳＥＮＳ ＳＢꎬ ＳＭＥＴＳ ＥＦꎬ ＡＬＥＸＡＮＤＥＲ Ｖꎬ ２０１２. Ｆｌｏｒａｌ
ｖａｒｉａｎｔ ｃａｌｌ ｆｏｒｍａｔ ａｎｄ ＶＣＦ ｔｏｏｌｓ[Ｊ]. Ｂｉｏｉｎｆｏｒｍꎬ ２７(１５): ｄｅｖｅｌｏｐｍｅｎｔ ｏｆ Ｈｙｄｒｏｃｅｒａ ａｎｄ Ｉｍｐａｔｉｅｎｓ ｒｅｖｅａｌｓ ｅｖｏｌｕｔｉｏｎａｒｙ
２１５６－２１５８. ｔｒｅｎｄｓ ｉｎ ｔｈｅ ｍｏｓｔ ｅａｒｌｙ ｄｉｖｅｒｇｅｄ ｌｉｎｅａｇｅｓ ｏｆ ｔｈｅ
ＤＡＶＥＹ ＪＷꎬ ＨＯＨＥＮＬＯＨＥ ＰＡꎬ ＥＴＴＥＲ ＰＤꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ Ｂａｌｓａｍｉｎａｃｅａｅ [Ｊ]. Ａｎｎ Ｂｏｔꎬ (７): １２８５－１２９６.
２０１１. Ｇｅｎｏｍｅ￣ｗｉｄｅ ｇｅｎｅｔｉｃ ｍａｒｋｅｒ ｄｉｓｃｏｖｅｒｙ ａｎｄ ｇｅｎｏｔｙｐｉｎｇ ＪＥＮＮＥＲＳＴＥＮ Ｏꎬ １９８８. Ｐｏｌｌｉｎａｔｉｏｎ ｉｎ Ｄｉａｎｔｈｕｓ ｄｅｌｔｏｉｄｅｓ
ｕｓｉｎｇ ｎｅｘｔ￣ｇｅｎｅｒａｔｉｏｎ ｓｅｑｕｅｎｃｉｎｇ [Ｊ]. Ｎａｔ Ｒｅｖ Ｇｅｎｅｔꎬ １２: ( Ｃａｒｙｏｐｈｙｌｌａｃｅａｅ ): ｅｆｆｅｃｔ ｏｆ ｈａｂｉｔａｔ ｆｒａｇｍｅｎｔａｔｉｏｎ ｏｎ
４９９－５１０. ｖｉｓｉｔａｔｉｏｎ ａｎｄ ｓｅｅｄ ｓｅｔ [Ｊ]. Ｃｏｎｓｅｒｖ Ｂｉｏｌꎬ ２: ３５９－３６６.
ＤＩＸＯ Ｍꎬ ＭＥＴＺＧＥＲ ＪＰꎬ ＭＯＲＧＡＮＴＥ ＪＳꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２００９. ＪＩＡＮＧ ＹＸꎬ ＷＡＮＧ ＢＳꎬ ＺＡＮＧ ＲＧꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２００２. Ｔｒｏｐｉｃａｌ
Ｈａｂｉｔａｔ ｆｒａｇｍｅｎｔａｔｉｏｎ ｒｅｄｕｃｅｓ ｇｅｎｅｔｉｃ ｄｉｖｅｒｓｉｔｙ ａｎｄ ｒａｉｎｆｏｒｅｓｔ ｂｉｏｄｉｖｅｒｓｉｔｙ ａｎｄ ｉｔｓ ｆｏｒｍａｔｉｏｎ ｍｅｃｈａｎｉｓｍ ｉｎ Ｈａｉｎａｎ
ｃｏｎｎｅｃｔｉｖｉｔｙ ａｍｏｎｇ ｔｏａｄ ｐｏｐｕｌａｔｉｏｎｓ ｉｎ ｔｈｅ Ｂｒａｚｉｌｉａｎ Ａｔｌａｎｔｉｃ Ｉｓｌａｎｄ [Ｍ]. Ｂｅｉｊｉｎｇ: Ｓｃｉｅｎｃｅ Ｐｒｅｓｓ: ３０－８４. [蒋有绪ꎬ 王
Ｃｏａｓｔａｌ Ｆｏｒｅｓｔ [Ｊ]. Ｂｉｏｌ Ｃｏｎｓｅｒｖꎬ １４２(８): １５６０－１５６９. 伯荪ꎬ 藏润国ꎬ 等ꎬ ２００２. 海南岛热带雨林生物多样性及
ＥＸＣＯＦＦＩＥＲ Ｌꎬ ＬＩＳＣＨＥＲ ＨＥꎬ ２０１０. Ａｒｌｅｑｕｉｎ ｓｕｉｔｅ ｖｅｒ ３.５: ａ 其形成机制 [Ｍ]. 北京: 科学出版社: ３０－８４.]
ｎｅｗ ｓｅｒｉｅｓ ｏｆ ｐｒｏｇｒａｍｓ ｔｏ ｐｅｒｆｏｒｍ ｐｏｐｕｌａｔｉｏｎ ｇｅｎｅｔｉｃｓ ＪＩＮＧ ＺＹꎬ ＣＨＥＮＧ ＫＧꎬ ＳＨＵ Ｈꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０２３. Ｗｈｏｌｅ ｇｅｎｏｍｅ
ａｎａｌｙｓｅｓ ｕｎｄｅｒ Ｌｉｎｕｘ ａｎｄ Ｗｉｎｄｏｗｓ [Ｊ]. Ｍｏｌ Ｅｃｏｌ Ｒｅｓｏｕｒꎬ ｒｅｓｅｑｕｅｎｃｉｎｇ ａｐｐｒｏａｃｈ ｆｏｒ ｃｏｎｓｅｒｖａｔｉｏｎ ｂｉｏｌｏｇｙ ｏｆ ｅｎｄａｎｇｅｒｅｄ
１０(３): ５６４－５６７. ｐｌａｎｔｓ [Ｊ]. Ｂｉｏｄｉｖｅｒｓ Ｓｃｉꎬ ３１(５): ２２６７９. [景昭阳ꎬ 程可
ＦＡＮ ＱＣꎬ ＳＵＮ Ｑꎬ ＬＩ Ｎꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２００４. Ｐｅｒｉｏｄｓ ｏｆ ｖｏｌｃａｎｉｃ 光ꎬ 舒恒ꎬ 等ꎬ ２０２３. 全基因组重测序方法在濒危植物保
ａｃｔｉｖｉｔｙ ａｎｄ ｍａｇｍａ ｅｖｏｌｕｔｉｏｎ ｏｆ Ｈｏｌｏｃｅｎｅ ｉｎ Ｎｏｒｔｈ Ｈａｉｎａｎ 护中的应用 [Ｊ]. 生物多样性ꎬ ３１(５): ２２６７９.]
Ｉｓｌａｎｄ [Ｊ]. Ａｃｔａ Ｐｅｔｒ Ｓｉｎꎬ ２０(３): ５３３－５４４. [樊祺诚ꎬ 孙 ＬＡＭＯＮＴ ＢＢꎬ ＫＬＩＮＫＨＡＭＥＲ ＰＧＬꎬ ＷＩＴＫＯＷＳＫＩ ＥＴＦꎬ
谦ꎬ 李霓ꎬ 等ꎬ ２００４. 琼北火山活动分期与全新世岩浆演 １９９３. Ｐｏｐｕｌａｔｉｏｎ ｆｒａｇｍｅｎｔａｔｉｏｎ ｍａｙ ｒｅｄｕｃｅ ｆｅｒｔｉｌｉｔｙ ｔｏ ｚｅｒｏ ｉｎ
化 [Ｊ]. 岩石学报ꎬ ２０(３): ５３３－５４４.] Ｂａｎｋｓｉａ ｇｏｏｄｉｅ — ａ ｄｅｍｏｎｓｔｒａｔｉｏｎ ｏｆ ｔｈｅ Ａｌｌｅｅ ｅｆｆｅｃｔ
ＧＩＲＯＤ Ｃꎬ ＶＩＴＡＬＩＳ Ｒꎬ ＬＥＢＬＯＩＳ Ｒꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０１１. Ｉｎｆｅｒｒｉｎｇ [Ｊ]. Ｏｅｃｏｌｏｇｉａꎬ ９４: ４４６－４５０.
ｐｏｐｕｌａｔｉｏｎ ｄｅｃｌｉｎｅ ａｎｄ ｅｘｐａｎｓｉｏｎ ｆｒｏｍ ｍｉｃｒｏｓａｔｅｌｌｉｔｅ ｄａｔａ: ａ ＬＡＭ￣ＴＵＮＧ Ｎꎬ ＳＣＨＭＩＤＴ ＨＡꎬ ＡＲＮＤＴ ＶＨꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０１５. ＩＱ￣
ｓｉｍｕｌａｔｉｏｎ￣ｂａｓｅｄ ｅｖａｌｕａｔｉｏｎ ｏｆ ｔｈｅ Ｍｓｖａｒ ｍｅｔｈｏｄ [ Ｊ ]. ＴＲＥＥ: Ａ ｆａｓｔ ａｎｄ ｅｆｆｅｃｔｉｖｅ ｓｔｏｃｈａｓｔｉｃ ａｌｇｏｒｉｔｈｍ ｆｏｒ
Ｇｅｎｅｔｉｃｓꎬ １８８(１): １６５－１７９. ｅｓｔｉｍａｔｉｎｇ ｍａｘｉｍｕｍ￣ｌｉｋｅｌｉｈｏｏｄ ｐｈｙｌｏｇｅｎｉｅｓ [ Ｊ]. Ｍｏｌ Ｂｉｏｌ
ＧＩＴＺＥＮＤＡＮＮＥＲ ＭＡꎬ ＳＯＬＴＩＳ ＰＳꎬ ２０００. Ｐａｔｔｅｒｎｓ ｏｆ ｇｅｎｅｔｉｃ Ｅｖｏｌꎬ (１): ２６８－２７４.
ｖａｒｉａｔｉｏｎ ｉｎ ｒａｒｅ ａｎｄ ｗｉｄｅｓｐｒｅａｄ ｐｌａｎｔ ｃｏｎｇｅｎｅｒｓ [Ｊ]. Ａｍ Ｊ ＬＡＰＩＥＲＲＥ Ｍꎬ ＬＡＭＢＥＲＴ Ａꎬ ＡＣＨＡＺ Ｇꎬ ２０１７. Ａｃｃｕｒａｃｙ ｏｆ
Ｂｏｔꎬ ８７: ７８３－７９２. ｄｅｍｏｇｒａｐｈｉｃ ｉｎｆｅｒｅｎｃｅｓ ｆｒｏｍ ｔｈｅ ｓｉｔｅ ｆｒｅｑｕｅｎｃｙ ｓｐｅｃｔｒｕｍ:
ＧＵＩＮＤＯＮ Ｓꎬ ＤＵＦＡＹＡＲＤ ＪＦꎬ ＬＥＦＯＲＴ Ｖꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０１０. Ｎｅｗ ｔｈｅ ｃａｓｅ ｏｆ ｔｈｅ Ｙｏｒｕｂａ ｐｏｐｕｌａｔｉｏｎ [Ｊ]. Ｇｅｎｅｔｉｃｓꎬ ２０６(１):
ａｌｇｏｒｉｔｈｍｓ ａｎｄ ｍｅｔｈｏｄｓ ｔｏ ｅｓｔｉｍａｔｅ ｍａｘｉｍｕｍ￣ｌｉｋｅｌｉｈｏｏｄ ４３９－４４９.
ｐｈｙｌｏｇｅｎｉｅｓ: ａｓｓｅｓｓｉｎｇ ｔｈｅ ｐｅｒｆｏｒｍａｎｃｅ ｏｆ ＰｈｙＭＬ ３.０ ＬＡＵＲＡＮＣＥ ＷＦꎬ ＣＬＥＭＥＮＴＳ ＧＲꎬ ＳＬＯＡＮ Ｓꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０１４. Ａ
[Ｊ]. Ｓｙｓｔ Ｂｉｏｌꎬ ５９(３): ３０７－３２１. ｇｌｏｂａｌ ｓｔｒａｔｅｇｙ ｆｏｒ ｒｏａｄ ｂｕｉｌｄｉｎｇ [Ｊ]. Ｎａｔｕｒｅꎬ ５１３: ２２９－２３２.
ＧＵＴＥＮＫＵＮＳＴ ＲＮꎬ ＨＥＲＮＡＮＤＥＺ ＲＤꎬ ＷＩＬＬＩＡＭＳＯＮ ＳＨꎬ ｅｔ ＬＩ Ｈꎬ ＤＵＲＢＩＮ Ｒꎬ ２０１１. Ｉｎｆｅｒｅｎｃｅ ｏｆ ｈｕｍａｎ ｐｏｐｕｌａｔｉｏｎ ｈｉｓｔｏｒｙ
ａｌ.ꎬ ２００９. Ｉｎｆｅｒｒｉｎｇ ｔｈｅ ｊｏｉｎｔ ｄｅｍｏｇｒａｐｈｉｃ ｈｉｓｔｏｒｙ ｏｆ ｍｕｌｔｉｐｌｅ ｆｒｏｍ ｉｎｄｉｖｉｄｕａｌ ｗｈｏｌｅ￣ｇｅｎｏｍｅ ｓｅｑｕｅｎｃｅｓ [ Ｊ ]. Ｎａｔｕｒｅꎬ
ｐｏｐｕｌａｔｉｏｎｓ ｆｒｏｍ ｍｕｌｔｉｄｉｍｅｎｓｉｏｎａｌ ＳＮＰ ｆｒｅｑｕｅｎｃｙ ｄａｔａ ４７５(７３５７): ４９３－４９６.
