Page 123 - 《广西植物》2024年第7期
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7 期 林立等: 代谢组与转录组联合解析赤皮青冈叶片黄化变异机制 1 3 2 3
图 1 赤皮青冈黄化植株 (A)和叶色对比图(B)
Fig. 1 Etiolated plant ( A ) and leaf color contrast ( B ) of Quercus gilva
表 1 qPCR 引物序列
Table 1 Primer sequences for qPCR
基因名称 正向引物序列 (5′→ 3′) 反向引物序列 (5′→ 3′)
Gene name Forward primer sequence (5′→ 3′) Reverse primer sequence (5′→ 3′)
CACs TCTGGGAGAAGAGTGGCTACA GAGCCACCATTCAAATCCT
FLS CCTCCTTCCACCATCAACTA ATGACCTTCAACCCCTAACC
CHS CAGCAACAAAGGCAATCAA GACAAGAACACGAGCACCC
UROD CTTCTTTCTTTGCTCCTTT GGTCTTTCAACATCTTCCC
psaL GTCCAATCTGAAAAGCCAA GTCCAACAAGGAGAAACCC
psaV CTCTTCCTCCACCTTGTTC GTGCTTGACTTGGTTTTTG
ELIP CAACACCTCAGCCACCACA GCAGCAACAAAGCCAATCA
MYB7 TCACCTGCCAAAGCCCGTT CCGACCCCATTTTCACCGT
Cab GGAACTAAAGAATGGGAGG CAGCAATATGGTCGAAGAG
2.2.3 DEGs 的 GO 功能分析 GO 分析表明ꎬYL 和 体ꎬ其次为类囊体膜、光合膜、叶绿体类囊体膜等ꎬ
NYL 的 3 612 个 DEGs( P < 0.05) 显著富集到 12 均以下调基因的数目较多ꎮ 在分子功能中ꎬ存在
个生物学过程、14 个细胞组分和 2 个分子功能条 显著差异的代谢途径最少ꎬ仅有四吡咯结合和叶
目(图 5)ꎮ 在生物学过程中ꎬ富集基因最多的是 绿素结合ꎬ均以下调基因居多ꎬ其中叶绿素结合途
前体代谢产物和能量产生ꎬ其次为光合作用、色素 径当中的下调基因占总数的 90%以上ꎮ GO 功能
生物合成过程、色素代谢过程、卟啉化合物生物合 富集分析表明ꎬYL 的叶色黄化突变与光合作用、
成过程等ꎬ涉及过程多与光合作用或叶绿素合成 叶绿素代谢等过程有密切关系ꎮ
有关ꎬ以下调基因为主ꎬ也有少数与磷酸脱氢酶、 2.2.4 差异代谢途径的 KEGG 富集分析 KEGG 富
质体丙酮酸激酶、葡萄糖基转移酶及二氢黄酮醇 集分 析 结 果 显 示ꎬ 共 有 744 条 DEGs 被 注 释 到
还原酶相关的代谢途径发生了不同程度上调ꎮ 在 KEGG 通路ꎬ其中 192 条基因显著富集到植物-病
细胞组分中ꎬ富集最多的 GO 条目是质体和叶绿 原体相互作用、光合作用、乙醛酸及二羧酸代谢等