Page 127 - 《广西植物》2024年第7期
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７ 期 林立等: 代谢组与转录组联合解析赤皮青冈叶片黄化变异机制 １ ３ ２ ７
表 ３ 赤皮青冈转录组测序质量分析
Ｔａｂｌｅ ３ Ｑｕａｌｉｔｙ ａｎａｌｙｓｉｓ ｏｆ ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｏｍｅ ｓｅｑｕｅｎｃｉｎｇ ｏｆ Ｑｕｅｒｃｕｓ ｇｉｌｖａ
干净数据 错误率 Ｑ２０ 比例 Ｑ３０ 比例 ＧＣ 含量
样品名称 干净序列
Ｃｌｅａｎ ｄａｔａ Ｅｒｒｏｒ ｒａｔｅ Ｑ２０ ｒａｔｉｏ Ｑ３０ ｒａｔｉｏ ＧＣ ｃｏｎｔｅｎｔ
Ｓａｍｐｌｅ ｎａｍｅ Ｃｌｅａｎ ｒｅａｄｓ
(ｂｐ) (％) (％) (％) (％)
ＹＬ￣１ ６ ７１２ ４５８ ６７７ ４５ ８３６ ３２６ ０.０３ ９７.６１ ９３.０３ ４４.５０
ＹＬ￣２ ７ ６８９ ２２９ ８８８ ５２ ６４７ ４８８ ０.０３ ９７.６９ ９３.３１ ４４.９９
ＹＬ￣３ ７ ３７２ １２８ ３８２ ５０ ３７５ ７１０ ０.０３ ９７.６４ ９３.０７ ４４.４９
ＮＹＬ￣１ ６ ３８１ ５６４ ９０５ ４３ ８６４ １２２ ０.０３ ９７.７０ ９３.２５ ４４.７３
ＮＹＬ￣２ ８ ２２７ ８１２ ３５４ ５６ ５９４ ９４４ ０.０３ ９７.７４ ９３.３１ ４４.７６
ＮＹＬ￣３ ７ ８７１ ９４２ ６８０ ５３ ８１１ ６３４ ０.０３ ９７.７９ ９３.４９ ４４.７８
图 ４ ＹＬ 和 ＮＹＬ 组间差异表达基因的韦恩图(Ａ)和差异表达基因上 / 下调统计图(Ｂ)
Ｆｉｇ. ４ Ｖｅｎｎ ｄｉａｇｒａｍ ( Ａ ) ａｎｄ ｓｔａｔｉｓｔｉｃａｌ ｃｈａｒｔ ｆｏｒ ＤＥＧｓ ｕｐ/ ｄｏｗｎ ｒｅｇｕｌａｔｉｏｎ ( Ｂ ) ｂｅｔｗｅｅｎ ＹＬ ａｎｄ ＮＹＬ
对４ １４６个 ＤＥＧｓ 中的转录因子基因进行鉴定ꎬ共筛 叶绿素 ａ / ｂ 的比值也显著降低( 图 ８)ꎬ表明 ＹＬ 可
得 ３９ 个转录因子相关基因ꎬ属于 １５ 个家族(图 ６)ꎮ 能受到环境胁迫( Ｓｕｎ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０２２)ꎮ 该比值的变
其中ꎬ 差 异 基 因 数 目 最 多 的 是 ＭＹＢ 家 族 ( ８ 个 化会造成叶绿素 ａ 对不同波长吸收的改变ꎬ进而
ＤＥＧｓ)ꎬＡＰ２ / ＥＲＦ 和 ｂＨＬＨ 次之ꎬ分别有 ５ 个和 ４ 对叶色产生影响(李丽菁等ꎬ２０２２)ꎮ
个ꎬＷＲＫＹ、ｂＺＩＰ 和 ＳＢＰ 则都有 ３ 个ꎮ １５ 个转录因 在叶绿素合成途径中ꎬ谷氨酸￣ｔＲＮＡ 还原酶
子家族中ꎬ ＷＲＫＹ、ＧＲＡＳ、ＡＰ２ / ＥＲＦ 和 Ｃ２Ｈ２ 以下 (ｇｌｕｔａｍｙｌ￣ｔＲＮＡ ｒｅｄｕｃｔａｓｅꎬＨｅｍＡ)、尿 卟 啉 原 脱 羧
调基因居多ꎬ其他则以上调为主ꎮ 酶(ｕｒｏｐｏｒｐｈｙｒｉｎｏｇｅｎ ｄｅｃａｒｂｏｘｙｌａｓｅꎬＨｅｍＥ)、原卟啉
２.２. ６ ＤＥＧｓ 的 ＲＴ￣ｑＰＣＲ 验 证 分 析 选 取 ８ 个 原氧化酶(ｐｒｏｔｏｐｏｒｐｈｙｒｉｎｏｇｅｎ ｏｘｉｄａｓｅꎬＨｅｍＦ)、原叶
ＤＥＧｓ 进行 ｑＰＣＲ 验证ꎬ结果(图 ７)表明ꎬ荧光定量 绿 素 酸 酯 氧 化 还 原 酶 ( ｐｒｏｔｏｃｈｌｏｒｏｐｈｙｌｌｉｄｅ
表达与转录组基因表达的变化趋势一致ꎬ证实转 ｏｘｉｄｏｒｅｄｕｃｔａｓｅꎬＰＯＲ) 等 ９ 种酶的相关 ＤＥＧｓ 都出
录组数据可靠ꎮ 现下 调 表 达ꎬ 其 中 编 码 ＨｅｍＥ 的 基 因 下 降 ８０％
２.３ ＹＬ 的 ＤＥＧｓ 和 ＳＣＭｓ 关联分析 (４ / ５)ꎬ编 码 ＰＯＲ 的 ２ 个 基 因 表 达 量 下 调 超 过
２.３.１ 色素代谢相关 ＤＥＧｓ 和 ＳＣＭｓ 的关联分析 ６６.７％( ２ / ３)ꎬ编 码 ＨｅｍＡ、ＨｅｍＢ ( δ￣ａｍｉｎｏｌｅｖｕｌｉｎｉｃ
植物叶片颜色主要由叶绿素、类胡萝卜素、花青素 ａｃｉｄ ｄｅｈｙｄｒａｔａｓｅ)、ＤＶＲ(ｄｉｖｉｎｙｌ ｐｒｏｔｏｃｈｌｏｒｏｐｈｙｌｌｉｄｅ ａ
等植物色素决定( 林馨颖等ꎬ２０２２)ꎮ 通过测定赤 ８￣ｖｉｎｙｌ￣ｒｅｄｕｃｔａｓｅ)和 ＣｈｌＩ(Ｍｇ￣ｃｈｅｌａｔａｓｅ ｓｕｂｕｎｉｔ ＣｈｌＩ￣
皮青冈 ＹＬ 和 ＮＹＬ 的叶绿素和类胡萝卜素含量ꎬ １)的基因表达下调都均约 ５０％(图 ９:Ａ)ꎮ
￣１ 类胡萝卜素也是参与植物光合作用的主要色
发现 ＹＬ 中 叶 绿 素 ａ ( ０. ３５ ｍｇ ｇ )、 叶 绿 素 ｂ
(０.３１ ｍｇｇ )、总叶绿素(０.６６ ｍｇｇ ) 以及类 素之一ꎮ ＹＬ 中类胡萝卜素含量[(０.０５６ １±０.００８
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胡萝卜素(０.０５ ｍｇｇ )的含量都较 ＮＹＬ( 分别为 ９)ｍｇｇ ]较 ＮＹＬ(０.４４１ ５±０.０８３ ０ ｍｇｇ ) 显
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２.３８、１.４９、３.８７、０.４４ ｍｇｇ ) 显著下降ꎮ 此外ꎬ 著减少ꎮ 在 类 胡 萝 卜 素 生 物 合 成 途 径 中 ( 图 ９:
