Page 128 - 《广西植物》2020年第1期

１ ２ ４ 广 西 植 物 ４０ 卷

Ａ. ＲｒＧＬ２ 与其他物种的序列比对图ꎻ Ｂ. 二级结构域 ＨＯＸ (１０７ ~ １６９ ａａ) 和 ＳＴＡＲＴ (２７６ ~ ５００ ａａ)ꎻ Ｃ. ＲｒＧＬ２ 的三级结构域
(ＰＤＢ: ２Ｚ９Ｚ)ꎮ
Ａ. Ａｍｉｎｏ ａｃｉｄ ｓｅｑｕｅｎｃｅ ａｌｉｇｎｍｅｎｔｓ ｏｆ ＲｒＧＬ２ ｗｉｔｈ ｏｔｈｅｒ ｆｉｖｅ ｐｌａｎｔｓꎻ Ｂ. Ｔｈｅ ｓｅｃｏｎｄ ｍｏｔｉｆｓ ＨＯＸ (１０７－１６９ ａａ) ａｎｄ ＳＴＡＲＴ (２７６－５００ ａａ)ꎻ
Ｃ. Ｔｈｅ ｔｈｉｒｄ ｄｉｍｅｎｓｉｏｎａｌ ｐｒｏｔｅｉｎ ｓｔｒｕｃｔｕｒｅ ｏｆ ＲｒＧＬ２ (ＰＤＢ ｎｕｍｂｅｒ: ２Ｚ９Ｚ).
图 ３ ＲｒＧＬ２ 的结构
Ｆｉｇ. ３ Ｓｔｒｕｃｔｕｒｅ ｏｆ ＲｒＧＬ２

２.３ ＲｒＧＬ２ 的同源蛋白和系谱树分析 利用 ＥＳＰｒｉｐｔ ３.０ 得到蛋白质的二级结构和三级结
将不同物种的 ＧＬ２ 进行比对分析( 图 ３:Ａ)ꎮ 构ꎮ 如图 ３:Ａ 所示ꎬβ－转角是序列的主要二级结
ＢＬＡＳＴ 分 析 表 明ꎬ ＲｒＧＬ２ 和 野 草 莓 ( Ｆｒａｇａｒｉａ 构ꎮ 多序列比对的结果表明ꎬＲｒＧＬ２ 与其他物种
ｖｅｓｃａ)、碧桃( Ｐｒｕｎｕｓ ｐｅｒｓｉｃａ)、苹果( Ｍａｌｕｓ ｄｏｍｅｓｔｉ￣ 的二 级 结 构 域 也 较 为 保 守ꎮ ＳＭＡＲＴ 分 析 显 示
ｃａ)、麻风树(Ｊａｔｒｏｐｈａ ｃｕｒｃａｓ)和桑(Ｍｏｒｕｓ ｎｏｔａｂｉｌｉｓ) ＲｒＧＬ２ 的结构域包括两个主要结构域ꎬ分别是位
的蛋 白 质 序 列 相 似 性 较 高ꎬ 分 别 是 ９８％、 ９２％、 于 １０７ ~ １６９ 氨 基 酸 的 同 源 结 构 域 ＨＯＸ
９０％、８３％和 ８２％相似性ꎮ (ｈｏｍｅｏｂｏｘ) 和 位 于 ２７６ ~ ５００ 氨 基 酸 的 ＳＴＡＲＴ
基于 ＲｒＧＬ２ 的三维结构( ＰＤＢ 编号:２Ｚ９Ｚ)ꎬ (ＳｔＡＲ 和磷酰胆碱转移蛋白) ( 图 ３:Ｂ)ꎮ 图 ３:Ｃ