Page 66 - 《广西植物》2020年第2期
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2 期 王伟妍等: 滇龙胆 8 ̄羟香叶醇氧化还原酶基因的克隆与表达分析 2 0 3
黑色表示相似性等于 100%ꎻ粉红色表示 75%≤相似性<100%ꎻ浅蓝色表示 50%≤相似性<75%ꎮ
Black indicates similarity = 100%ꎻ Pink indicates 75%≤similarity<100%ꎻ Light blue indicates 50%≤similarity<75%.
图 2 Gr8HGO 蛋白与其他植物 8HGO 蛋白的多序列比对结果
Fig. 2 Multiple sequence alignment of Gr8HGO proteins and 8HGO proteins in other plants
性 引 物 共 克 隆 到 5 个 Gr8HGO 基 因ꎬ 分 别 为 Cr8HGO 蛋白序列相似性均最高ꎬ分别为 84.31%、
Gr8HGO ̄1(KP722029.1)、Gr8HGO ̄2(KP722030.1)、 84.31%、84.84%、84.57%、84.84%ꎬ其次是中果咖
Gr8HGO ̄3(KP722031.1)、Gr8HGO ̄4(KP722032.1)、 啡 81.25%、81.07%、81.33%、81.07%、81.33%ꎬ再
Gr8HGO ̄5(KP722052.1)ꎬ其中 Gr8HGO ̄1 基因 ORF 次是 油 橄 榄 73. 86%、73. 87%、74. 13%、73. 87%、
长 1 062 bpꎬ编码 353 个氨基酸ꎻ其余 4 条基因 ORF 74.13%ꎮ 多序列比对分析结果表明 5 个 Gr8HGO
长 1 131 bpꎬ编码 376 个氨基酸ꎮ 蛋白与已知 8HGO 蛋白序列相似性很高(图 2)ꎬ总
2.2 Gr8HGO 基因的生物信息学分析 体相似度高达 91.27%ꎮ 利用 MEGA X 将 Gr8HGO
利用 GenBank 数 据 库 中 的 BLASTp 程 序 和 氨基酸序列与 BLASTp 比对中相似性较高的蛋白
DNAMAN 7 对 Gr8HGO 蛋白的氨基酸序列进行相 氨基酸序列进行系统发育分析ꎬ结果显示 5 个滇
似性分析ꎬ结果表明滇龙胆 Gr8HGO ̄1、Gr8HGO ̄2、 龙胆 Gr8HGO 蛋白与长春花 Cr8HGO 蛋白处于同
Gr8HGO ̄3、Gr8HGO ̄4、 Gr8HGO ̄5 蛋 白 与 长 春 花 一进化枝(图 3)ꎬ表明它们的亲缘关系较近ꎮ