Page 68 - 《广西植物》2020年第2期
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2 期 王伟妍等: 滇龙胆 8 ̄羟香叶醇氧化还原酶基因的克隆与表达分析 2 0 5
表 1 Gr8HGO 蛋白的理化性质
Table 1 Physicochemical properties of Gr8HGO proteins
相对分子 带正电氨基 带负电氨基 总平均
质量 理论 酸残数目 酸残数目 不稳定 脂肪指数 疏水性 疏水蛋白
蛋白 长度 Relative 等电点 Number of Number of 指数
Aliphatic Grand Hydrophobic
Protein Length molecular Theoretical positively negatively Instability
index average of protein
weight pI charged charged index
hydropathicity
(kD) residues residues
Gr8HGO ̄1 353 37.50 5.60 32 39 26.99 98.24 0.161 是 Yes
Gr8HGO ̄2 376 39.95 5.47 32 41 28.00 98.96 0.195 是 Yes
Gr8HGO ̄3 376 40.02 5.69 33 40 27.87 99.73 0.205 是 Yes
Gr8HGO ̄4 376 40.01 5.95 34 39 26.90 99.73 0.203 是 Yes
Gr8HGO ̄5 376 40.02 5.69 33 40 27.87 99.73 0.205 是 Yes
Cr8HGO 378 40.41 6.27 38 41 33.64 93.04 0.060 是 Yes
表 2 Gr8HGO 蛋白的其他性质
Table 2 Other properties of Gr8HGO proteins
延伸链
α ̄螺旋 β ̄转角 无规则卷曲 信号肽 跨膜螺旋 叶绿体转运肽
蛋白 Extended
α ̄helix β ̄turn Random coil Signal Transmembrane Chloroplast
Protein strand
(%) (%) (%) peptide helix transit peptide
(%)
Gr8HGO ̄1 27.20 8.50 42.78 21.53 无 None 无 None 无 None
Gr8HGO ̄2 23.14 9.84 38.83 28.19 无 None 无 None 无 None
Gr8HGO ̄3 24.73 9.31 40.69 25.27 无 None 无 None 无 None
Gr8HGO ̄4 23.40 10.11 39.10 27.39 无 None 无 None 无 None
Gr8HGO ̄5 24.73 9.31 40.69 25.27 无 None 无 None 无 None
Cr8HGO 23.54 8.73 42.06 25.66 无 None 无 None 无 None
表 3 Gr8HGO 蛋白和 Cr8HGO 蛋白的亚细胞定位预测
Table 3 Subcellular localization prediction of Gr8HGO proteins and Cr8HGO proteins
蛋白
ProtComp 9.0 Plant ̄mPLoc WoLF PSORT
Protein
Gr8HGO ̄1 细胞质 细胞质 胞外: 5ꎻ 细胞质: 3ꎻ 液泡: 3ꎻ 叶绿体: 1ꎻ 线粒体: 1ꎻ 内质网: 1
Cytoplasm Cytoplasm Extracellular: 5ꎻ cytoplasm: 3ꎻ vacuole: 3ꎻ chloroplast: 1ꎻ mitochondrion: 1ꎻ en ̄
doplasmic reticulum: 1
Gr8HGO ̄2 细胞质 细胞质 胞外: 6ꎻ 细胞质: 4ꎻ 叶绿体: 3ꎻ 细胞核: 1
Cytoplasm Cytoplasm Extracellular: 6ꎻ cytoplasm: 4ꎻ chloroplast: 3ꎻ nucleus: 1
Gr8HGO ̄3 细胞质 细胞质 胞外: 5ꎻ 细胞质: 3ꎻ 液泡: 3ꎻ 叶绿体: 1ꎻ 线粒体: 1ꎻ 内质网: 1
Cytoplasm Cytoplasm Extracellular: 5ꎻ cytoplasm: 3ꎻ vacuole: 3ꎻ chloroplast: 1ꎻ mitochondrion: 1ꎻ en ̄
doplasmic reticulum: 1
Gr8HGO ̄4 细胞质 细胞质 胞外: 5ꎻ 细胞质: 3ꎻ 液泡: 3ꎻ 叶绿体: 1ꎻ 线粒体: 1ꎻ 内质网: 1
Cytoplasm Cytoplasm Extracellular: 5ꎻ cytoplasm: 3ꎻ vacuole: 3ꎻ chloroplast: 1ꎻ mitochondrion: 1ꎻ en ̄
doplasmic reticulum: 1
Gr8HGO ̄5 细胞质 细胞质 胞外: 5ꎻ 细胞质: 3ꎻ 液泡: 3ꎻ 叶绿体: 1ꎻ 线粒体: 1ꎻ 内质网: 1
Cytoplasm Cytoplasm Extracellular: 5ꎻ cytoplasm: 3ꎻ vacuole: 3ꎻ chloroplast: 1ꎻ mitochondrion: 1ꎻ en ̄
doplasmic reticulum: 1
Cr8HGO 细胞质 细胞质 胞外: 6ꎻ 叶绿体: 3ꎻ 细胞质: 2ꎻ 液泡: 2ꎻ 细胞核: 1
Cytoplasm Cytoplasm Extracellular: 6ꎻ chloroplast: 3ꎻ cytoplasm: 2ꎻ vacuole: 2ꎻ nucleus: 1