Page 123 - 《广西植物》2023年第11期
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11 期                    刘保财等: 多花黄精种子萌发前后基因表达特征分析                                          2 0 8 3

                                         表 5  各样品表达水平 FPKM 区间数量统计
                                Table 5  FPKM interval quantity statistics of sample expression levels

                                                         FPKM 区间 FPKM interval
                样品
                Sample
                          0≤FPKM≤0.1   0.1<FPKM≤0.3  0.3<FPKM≤3.57  3.57<FPKM≤15  15<FPKM≤60      FPKM>60
                 A1      66 890(37.51%)  15 127(8.48%)  69 506(38.98%)  16 746(9.39%)  7 668(4.30%)  2 382(1.34%)
                 A2      65 674(36.83%)  13 669(7.67%)  71 197(39.93%)  17 542(9.84%)  7 856(4.41%)  2 381(1.34%)
                 A3      65 155(36.54%)  12 935(7.25%)  71 732(40.23%)  18 153(10.18%)  7 953(4.46%)  2 391(1.34%)
                 B1      45 729(25.64%)  8 928(5.01%)  84 666(47.48%)  26 418(14.82%)  9 731(5.46%)  2 847(1.60%)
                 B2      90 461(50.73%)  4 155(2.33%)  46 585(26.12%)  25 282(14.18%)  8 776(4.92%)  3 060(1.72%)

                 B3      92 713(51.99%)  2 373(1.33%)  42 307(23.73%)  28 240(15.84%)  9 676(5.43%)  3 010(1.69%)


























             A1. 氧化还原过程ꎻ A2. 代谢过程ꎻ A3. 脂肪酸生物合成过程ꎻ A4. 碳水化合物代谢过程ꎻ A5. 脂肪酸代谢过程ꎻ A6. 脂质代谢
             过程ꎻ A7. 细胞碳水化合物代谢过程ꎻ A8. 一元羧酸生物合成过程ꎻ A9. 脂质生物合成过程ꎻ A10. 细胞多糖代谢过程ꎻ A11. 核
             糖体生成ꎻ A12. 单生物代谢过程ꎻ A13. 核糖核蛋白复合物生成ꎻ A14. 细胞葡聚糖代谢过程ꎻ A15. 葡聚糖代谢过程ꎻ A16. 细胞
             壁ꎻ A17. 外部封装结构ꎻ A18. 核糖体ꎻ A19. 质外体ꎻ A20. 脂肪酸合成酶复合物ꎻ A21. 核糖核蛋白复合物ꎻ A22. 脂质颗粒ꎻ
             A23. 单层包围的脂质储存体ꎻ A24. 催化活性ꎻ A25. 氧化还原酶活性ꎻ A26. 水解酶活性ꎬ作用于糖基键ꎻ A27. 水解酶活性ꎬ水
             解 O ̄糖基化合物ꎻ A28. 四吡咯结合ꎻ A29. 血红素结合ꎻ A30. 铁离子结合ꎻ A31. 氧化还原酶活性ꎬ作用于配对供体ꎬ结合或减少
             分子氧ꎻ A32. 核糖体的结构成分ꎻ A33. 转移酶活性ꎬ转移除氨基酰基以外的酰基ꎮ
             A1. Oxidation ̄reduction processꎻ A2. Metabolic processꎻ A3. Fatty acid biosynthetic processꎻ A4. Carbohydrate metabolic processꎻ A5. Fatty
             acid metabolic processꎻ A6. Lipid metabolic processꎻ A7. Cellular carbohydrate metabolic processꎻ A8. Monocarboxylic acid biosynthetic
             processꎻ A9. Lipid biosynthetic processꎻ A10. Cellular polysaccharide metabolic processꎻ A11. Ribosome biogenesisꎻ A12. Single ̄organism
             metabolic processꎻ A13. Ribonucleoprotein complex biogenesisꎻ A14. Cellular glucan metabolic processꎻ A15. Glucan metabolic processꎻ
             A16. Cell wallꎻ A17. External encapsulating structureꎻ A18. Ribosomeꎻ A19. Apoplastꎻ A20. Fatty acid synthase complexꎻ A21.
             Ribonucleoprotein complexꎻ A22. Lipid particleꎻ A23. Monolayer ̄surrounded lipid storage bodyꎻ A24. Catalytic activityꎻ A25. Oxidoreductase
             activityꎻ A26. Hydrolase activityꎬ acting on glycosyl bondsꎻ A27. Hydrolase activityꎬhydrolyzing O ̄glycosyl compoundsꎻ A28. Tetrapyrrole
             bindingꎻ A29. Heme bindingꎻ A30. Iron ion bindingꎻ A31. Oxidoreductase activityꎬ acting on paired donorsꎬwith incorporation or reduction of
             molecular oxygenꎻ A32. Structuralconstituent of ribosomeꎻ A33. Transferase activityꎬ transferring acyl groups other than amino ̄acyl groups.
                                        图 2  萌发前(A)与萌发后(B)的基因表达差异
                                Fig. 2  Different expression genes before (A) and after (B) germination


            达基因参与的最主要生化代谢和信号转导途径ꎬ                              3)ꎮ 差异表达基因主要富集于核糖体、植物激素
            挑选 富 集 最 显 著 的 20 个 pathway 进 行 展 示 ( 图            信号转导、淀粉和蔗糖代谢、苯丙烷生物合成、脂
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