Page 124 - 《广西植物》2023年第11期
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2 0 8 4                                广  西  植  物                                         43 卷
                                                               个、淀粉和蔗糖代谢通路中 124 个、植物激素信号
                                                               转导通路中 104 个、类黄酮生物合成种 37 个、脂
                                                               肪酸生物合成 34 个和延长 34 个ꎬ以及花青素生物
                                                               合成中 8 个、黄酮和黄酮醇生物合成中 5 个ꎮ 这些
                                                               通路与种子萌发前后的生理变化和形态结构的形

                                                               成有着紧密的关系ꎮ
                                                                   为了进一步解析差异基因参与的通路变化ꎬ
                                                               将上调和下调的差异基因分别进行 KEGG pathway
                                                               富集ꎬ分别展示挑选富集的前 20 条通路( 上调图
                                                               4: Aꎻ下调图 4: B)ꎮ 在上调的显著性差异表达基
                                                               因中ꎬ主要富集于核糖体( ribosomeꎬ231 个)、吞噬

                                                               体(phagosomeꎬ74 个)、淀粉和蔗糖代谢(starch and
                                                               sucrose metabolismꎬ 76 个)、 植 物 激 素 信 号 转 导
                                                               ( plant hormone signal transductionꎬ56 个)、脂肪酸
                                                               延伸(fatty acid elongationꎬ24 个)等通路中ꎬ其中富
                                                               集到核糖体、淀粉和蔗糖代谢、脂肪酸伸长等通路
                                                               中的差异表达基因数显著富集ꎻ而下调的差异表
                                                               达 基 因 主 要 富 集 在 苯 丙 烷 类 生 物 合 成
                                                               (phenylpropanoid biosynthesisꎬ48 个)、植物激素信
                                                               号转导( plant hormone signal transductionꎬ48 个)、
                                                               淀粉和蔗糖代谢( starch and sucrose metabolismꎬ48
                                                               个)、 类 黄 酮 生 物 合 成 ( flavonoid biosynthesisꎬ 22
              A. 芪类、二芳基庚烷和姜醇生物合成ꎻ B. 淀粉与蔗糖的代                   个)等通路中ꎬ并且植物激素信号转导、淀粉和蔗
              谢ꎻ C. 鞘 脂 代 谢ꎻ D. 核 糖 体ꎻ E. 植 物 激 素 信 号 转 导ꎻ
                                                               糖代谢等通路的差异表达基因显著富集ꎮ 可见ꎬ
              F. 苯丙烷 类 生 物 合 成ꎻ G. 苯 丙 氨 酸 代 谢ꎻ H. 吞 噬 体ꎻ      参与植物激素信号转导、淀粉和蔗糖代谢等通路
              I. 戊糖和葡萄醛酸相互转化ꎻ J. 亚油酸代谢ꎻ K. 柠檬烯和
              蒎烯降解ꎻ L. 谷胱甘肽代谢ꎻ M. 半乳糖代谢ꎻ N. 类黄酮                中的差异表达基因ꎬ无论是上调还是下调ꎬ均有较
              生物合成ꎻ O. 黄酮和黄酮醇的生物合成ꎻ P. 脂肪酸延长ꎻ                  多的差异表达基因富集ꎬ这些基因可能与植物休
              Q. 脂肪酸合成ꎻ R. 氰基氨基酸代谢ꎻ S. 昼夜节律-植物ꎻ
                                                               眠、萌发等有着紧密的关系ꎮ
              T. 花色素苷生物合成ꎮ
                                                               2.4 萌发前后激素信号转导通路差异表达基因
              A.  Stilbenoidꎬ diarylheptanoid  and  gingerol  biosynthesisꎻ
              B. Starch and sucrose metabolismꎻ C. Sphingolipid metabolismꎻ  基于上述分析ꎬ参与植物激素和信号转导的
              D. Ribosomeꎻ E. Plant hormone signal transductionꎻ F.
                                                               基因在种子休眠与萌发过程中起着关键作用ꎬ为
              Phenylpropanoid biosynthesisꎻ G. Phenylalanine metabolismꎻ
                                                               此将萌发前后显著的差异基因进一步匹配到植物
              H. Phagosomeꎻ I. Pentose and glucuronate interconversionsꎻ
                                                               激素信号通路中ꎬ差异富集及表达量见图 5ꎬ结果
              J. Linoleic  acid metabolismꎻ K.  Limonene  and pinene
              degradationꎻ  L.  Glutathione  metabolismꎻ  M.  Galactose
                                                               表明富集于生长素通路中关键酶的 Unigenes 共有
              metabolismꎻ N. Flavonoid biosynthesisꎻ O. Flavone and flavonol
                                                               40 个(27 个上调ꎬ3 个下调)ꎬ主要编码的酶:生长
              biosynthesisꎻ P.  Fatty  acid  elongationꎻ  Q.  Fatty  acid
              biosynthesisꎻ R. Cyanoamino acid metabolismꎻ S. Circadian  素内向转运载体(auxin influx carrierꎬAUX1)、运输
              rhythm ̄plantꎻ T. Anthocyanin biosynthesis.
                                                               抑 制 响 应 蛋 白 1 ( transport inhibitor response 1ꎬ
                     图 3  差异基因 KEGG 通路富集                       TIR1)、 生 长 素 响 应 蛋 白 / 吲 哚 ̄3 ̄乙 酸 ( auxin ̄
              Fig. 3  KEGG pathway enrichment of differential genes
                                                               responsive protein / indole ̄3 ̄acetic acidꎬAUX / IAA)、
                                                               生长素响应因子(auxin response factorꎬARF)、生长
            肪酸生物合成和延伸、类黄酮生物合成、黄酮和黄                             素响应酰胺合成酶(gretchen hagen 3ꎬGH3)基因家
            酮醇的生物合成、花青素生物合成等通路中ꎬ显著                             族(auxin responsive GH3 gene family)、SAUR( small
            性差异表达的基因分别富集到核糖体通路中 307                            auxin up RNA)家族蛋白(SAUR family protein)ꎬ 并
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